黄连为多年生草本植物。根茎有分枝，形如鸡爪。叶基生，有长柄；叶片卵状三角形，三全裂，中央裂片棱形，羽状深裂，边缘有锐锯齿。 以“黄连之乡”、“黄连原产地”──石柱县所产最负盛名，其根条肥壮，质地坚实，肉色红黄，过去多为朝廷贡品，有清热祛湿、泻火解毒之药效。
石柱黄连为毛茛科黄连属植物黄连（Coptis chinensis Franch.），系常用名贵中药，始载于《神农本草经》，列为上品，以其根连珠色黄而故名，其性寒味苦，具有泻火、解毒、清热、燥湿等功能。
石柱是我国黄连的原始产地和久负盛名的“黄连之乡”，素以栽培历史悠久、种植规模大、产量甲全国、品质优良而闻名于世。唐天宝元年（742），石柱“上贡黄连十斤，木药子百粒”。北宋地理总志《太平寰宇记》载：“忠州领五县：临江、丰都、垫江、南宾、桂溪，土产苦药子、黄连……”。时州领五县，唯南宾（今石柱）县产黄连。清乾隆四十年（1775）《石柱厅志》记：“药味广产，黄连尤多，贾客往来，络绎不绝”。民国时期，石柱黄连年产量即达4000担。民国二十三年（1934）中国银行所编《四川省之药材》记：“味连，只有家种，专产石柱”。1959年《四川医学院学报》之《黄连史》曰：“峨眉、洪雅野生品种驰名天下，石柱栽培品种品质优良，产量甲全国”。1958和1962年，朝鲜、越南从石柱引种试栽黄连。1965—1982年，石柱调出种子8.4万公斤、种苗3273万株，派出技术人员20多人，提供技术资料3万余册，支援全国26个省、市、自治区发展黄连生产。1989年在山东泰安召开的全国道地药材学术研讨会上，石柱黄连被确认为道地黄连。1991年，国家农业部在石柱建立优质黄连商品基地。目前，全县拥有宜连地总面积70多万亩，常年保持在地黄连 5万亩，年均栽培和收获黄连1万亩，产量1500吨以上（其中外贸出口500吨），约占全国的60%和世界的40%，国内所需及销往国外者大多取给于此。
石柱不仅是全国乃至全世界最大的黄连生产、加工及出口基地，而且还是我国黄连的科研和教学基地。凡研究黄连的知名专家、学者无一未到过此地，凡与黄连有关的科技成果大多出自于此，凡记载黄连的典籍皆以石柱为主。新中国成立以来，科研人员在系统总结石柱黄连栽培技术的基础上，先后取得《造林栽连》、《黄连轮作技术》、《黄连选种研究》等项重大科技成果，完成国家质检总局、科技部和重庆市一系列黄连标准化、规范化、现代化研究及试验示范项目。2004年，石柱黄连获得国家地理标志产品保护，通过国家中药材GAP认证。2006年5月, 国家质检总局、国家标准化管理委员会正式批准并发布了《地理标志产品 石柱黄连》国家标准(代号：GB/T20358-2006)。
重庆石柱黄连有限公司是石柱黄连产业化的龙头企业和GAP的实施主体。公司集黄连生产、加工、科研、出口为一体，在6个生产企业和16个乡镇建立黄连GAP种植基地5万亩，在黄水镇建立了黄连GAP基地检验检测中心。公司生产的“神农”牌黄连被评为“中国著名畅销品牌”而畅销国内外。
